025 分子对接结果用Discover Studio进行可视化

这是最终对接的结果图

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分别是分子对接的原图,分子对接的二维图和分子对接的三维图。

1.首先就是将可视化的界面调整为白色的,右键Color——backgroud
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2.然后选择配体和受体相互作用界面,就是Receptor-Ligand Interaction,然后找到这个配体相互作用,就是Ligand Interaction,点击完成以后,它就把我们想要显示的的界面进行聚合了,这些不同的颜色代表的是不同的相互作用的类型,如果我们想知道这些具体的键代表什么可以点击左边的Interaction Option,然后你取消前面打钩,然后键消失的话,就说明它就是对应的键。
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3.将相互作用的线条展示出来,这里点击Show Type,就是前面打钩,就会展示出来,然后你将A点开以后,然后就可以查看具体的氨基酸残基和配体之间的结合,就是前面有打钩的就是对应的氨基酸。
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4.然后就是在可视化图里面,双击氨基酸,等选中的是自己的氨基酸的时候,右键Label——Add,然后object那里选择AninoAcid,然后就是下面选择3-Letter&ID#,然后颜色的话一般是选择黑色,然后点击一下应用就可以叉掉了。然后可能不好看,然后选择界面右键color By Molecule(Carbons)
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5.然后调整一下方向,尽量就是让它显示完全这些信息。然后点击file,然后就是保存了,然后可能需要设置一下dpi就是图像的辨别率。
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6.然后显示二级结构的话,然后就出来了我们的二维结构图。然后我们选择这个物质右键Display style,然后出来的我们选择Atom,然后选择Stick。然后我们氨基酸的残基也可以选择一下,Residue,然后可以选择Plate那个,其它的似乎就不需要调整了。然后大小就是按住ctrl,然后按鼠标滚轮就可以调整大小了。
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